Dalam upaya untuk memperkuat kehidupan spiritual dan mendukung kebutuhan ibadah masyarakat, Yayasan Pendidikan Anak Bangsa (YPAB) meluncurkan subprogram Pembangunan Gereja. Subprogram ini ditujukan untuk membangun atau merenovasi gereja di daerah-daerah terpencil yang belum memiliki fasilitas ibadah yang layak. Fokus utama dari program ini adalah memberikan tempat ibadah yang aman, nyaman, dan dapat mendukung kegiatan keagamaan bagi umat Kristen setempat. Salah satu proyek terbaru adalah pembangunan gereja di wilayah pedalaman, di mana sebelumnya umat harus melakukan ibadah di bangunan sementara yang tidak memadai. Dengan pembangunan gereja baru ini, diharapkan masyarakat dapat menjalankan ibadah dengan tenang, serta memiliki ruang untuk melakukan kegiatan sosial dan keagamaan lainnya. Program ini juga melibatkan partisipasi aktif dari masyarakat lokal, sehingga mereka merasa memiliki dan bertanggung jawab terhadap pemeliharaan gereja setelah selesai dibangun. Gereja yang dibangun dilengkapi dengan fasilitas dasar seperti ruang ibadah, aula serbaguna, serta ruang pendidikan agama bagi anak-anak. YPAB juga berkomitmen untuk memperhatikan aspek lingkungan dan budaya lokal, memastikan bahwa desain gereja selaras dengan tradisi dan kebutuhan masyarakat.